一、寶石中的羥基、水分子
通過分析寶石中的水分子形式，有助于鑒別部分寶石是否為合成品。天然祖母綠與助熔劑合成祖母綠區別在于天然祖母綠含有水分子在3400―3800cm-1有一強吸收峰，助熔劑合成祖母綠是在高溫熔融條件下結晶而成的，所以結構通道內一般不存在水分子；而水熱法合成祖母綠是在水熱條件下結晶生長而成的，在其結構通道中存在不等量的水分子和少量氯酸根離子，在紅外4357、4052、3490、2995、2830、2745 cm-1處有吸收。
二、人工充填處理珠寶玉石的鑒別
在珠寶玉石中，廣泛用到環氧樹脂膠做充填物，紅外光譜儀可以非常準確、快捷、無損分析到環氧樹脂的存在。但現在我們要特別注意，近在檢測樣品中，發現了有人在嘗試用其他物質，代替傳統的環氧樹脂，對翡翠進行充填處理。我們通過放大檢測、常規儀器檢測、紅外吸收光譜分析，相結合得出以下一些特征；放大觀察，從顯微鏡下觀察樣品的表面，粗糙不平滑，還是可以看到“酸蝕網紋”，影響其光澤較差。
在燈下透光觀察，其結構松散，基底發白，綠色分布較浮，顏色分布無層次感，這是由于經過酸洗后對其結構、顏色的影響，這與一般傳統的翡翠B貨特征相同。
在紫外熒光燈下觀察，長波無熒光，短波有中等強度的黃綠色熒光，一般翡翠A貨通常無熒光，如含蠟質物可見長波有藍白色熒光。
三、仿古玉的紅外吸收光譜
一些仿古玉器在制作中，常采用強酸腐蝕或高溫烘烤等方法進行做舊處理，經過上述處理后，玉器的表面會呈白渣化，或酸蝕殘化，對其玉質的鑒別帶來一定的難度。這時我們利用漫反射附件，對這些做舊處理的玉器進行鑒定。 紅外光譜儀在珠寶玉石鑒定中的應用還有很多很多，并還在不斷的開發中，對珠寶玉石的測試手段還在不斷完善中，紅外光譜的應用將會幫助我們解決珠寶玉石檢測中的難點、疑點。
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